El 28 de Agosto del año 2020, la Gobernación de Ñeembucú presentó la Bandera Departamental, como resultado de un Concurso Público convocado por el Ejecutivo Departamental, consciente de la importancia de afianzar la identidad de los habitantes del duodécimo departamento.
Por Ordenanza Departamental N°02/2020 se adopta la bandera departamental de la Gobernación de Ñeembucú, seleccionado por el fallo del Jurado Calificador, presentado por el Sr. Mario Antonio Dos Santos Silva con el seudónimo NINÍN.
La Ordenanza establece además: insertar en la segunda franja el escudo departamental, adoptado por Ordenanza N° 3/94, y disponer la utilización de carácter obligatorio, en todos los actos y ceremonias oficiales realizados en el departamento, así como en las instituciones educativas de carácter público o privado en la jurisdicción departamental.